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mRNA 加帽率检测前处理试剂盒

英文名称:mRNA Capping Rate Pretreatment Assay Kit
货号: HBP005001 HBP005002
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选择规格: 10T 100T
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中文:mRNA 加帽率检测前处理试剂盒
英文:mRNA Capping Rate Pretreatment Assay Kit
货号:HBP005001
规格:10T
中文同义词:mRNA 加帽率检测前处理试剂盒

产品概述:

加帽率是 mRNA 的疫苗的关键质量属性,因为在 mRNA 的 5'端需要有帽结构以保护mRNA 分子免受降解,并促进蛋白质翻译。
mRNA 加帽率检测样品前处理试剂盒,可对待检测加帽率的 mRNA 样品进行高效、可重现的处理以便进行 5’端序列的 LC-MS 分析。
该试剂盒包含预配制的 4×RNase H Mix、链霉亲和素磁珠和优化的方案,可在 3 小时内准备完成质谱待上机样品。


运输与保存方法

0℃以下运输;链霉亲和素磁珠与洗涤液于2~8℃储存,其余于-25~-15℃储存。

Q:磁珠法痕量检测核酸提取试剂盒

产品概述
本试剂盒基于自主研发的高效分离作用的磁珠,在独特的缓冲液系配合下,可以从小于200 μL的生物制品样本中提取宿主细胞(CHO、Vero、NS0、MDCK等)的微量DNA片段,纯化的核酸可适用于各种常规操作,包括PCR、RT-PCR、荧光定量PCR等各种下游实验。


储存条件
本试剂盒置于常温条件下可保存12个月。

Q:E.coli细胞残留DNA检测试剂盒(美版)

Q:CHO细胞残留DNA检测试剂盒(美版)

CHO细胞残留DNA检测试剂盒(美版)

HBP003304 100T

Q:CHO残留DNA检测试剂盒(PCR-荧光探针法)

产品信息



产品概述

CHO 残留 DNA 检测试剂盒是用于定量检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中 CHO 宿主细胞DNA残留的试剂盒。本试剂盒利用TaqMan荧光探针原理,定量检测样本中 CHO 残留 DNA。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 fg 水平。本试剂盒与宿主细胞残留 DNA样本前处理试剂盒(货号:HBP003604)配套使用,可准确定量样品中残留的微量 CHO 细胞DNA。试剂盒配套的 CHO DNA 定量参考品,已溯源至国家标准品。该试剂盒仅供研究使用,不可用于临床。本检测方法可溯源至中国药典方法,通则<3407>。


运输与保存方法

-25℃~-15℃运输;-25℃~-15℃避光保存。


有效期

规定存储条件下 12 个月。


适用机型

本产品适用但不限于以下仪器:7500 Real-Time PCR System (ABI),QuantStudio 5(ABI),SLAN-96P Real-TimePCR system,qTOWER3G(德国耶拿)


实验所需自备材料

荧光定量 PCR 仪1.5 ml 无菌离心管无菌无酶八联管或 96 孔 qPCR 板1000 μl,200 μl,10 μl 无菌低吸附带滤芯枪头1000 μl,200 μl,10 μl 移液枪


实验流程

1 CHO DNA 定量参考品的稀释和标准曲线的制备

用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将 CHO DNA 定量参考品进行梯度稀释,稀释浓度依次为 3 ng/μl、300 pg/μl、30 pg/μl、3 pg/μl、300 fg/μl、30 fg/μl、3 fg/μl。具体操作如下:

1)将试剂盒中的 CHO DNA 定量参考品和 DNA稀释液置于冰上融化,待完全融化后,轻微振荡混匀,瞬时离心 5 s。

2)取 7 支干净的 1.5 ml 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6。具体稀释方法见 Table 1。

3)CHO DNA定量参考品与DNA稀释液混合后,涡旋混匀 30 s,瞬时离心 10 s。

Q: 全能核酸酶(标准版)

产品信息




产品概述

全能 核酸酶是 一种来自 于粘质沙 雷氏菌(Serratia marcescens),经基因工程改造的核酸内切酶。能够在非常广泛的条件下(6MUrea,0.1M Guanidine HCl,0.4% TritonX-100,0.1% SDS,1mM EDTA,1mM PMSF)降解双链、单链、线状、环状的 DNA 和 RNA,完全将核酸降解成 3 5 个碱基长度的 5’-单磷酸寡核苷酸。本品经基因工程改造在 Escherichia coli (E.coli)中发酵表达纯化并制备,可应用于科学研究中降低细胞上清和细胞裂解液的粘度,提高蛋白纯化效率;可应用于工业酶催化领域,降低反应液粘度,提高催化效率;还可应用于重组蛋白生产过程中作为宿主残留核酸去除试剂,本品不含 His 标签,可利用金属亲和层析有效去除过程添加的核酸酶,尤其适合 His标签重组蛋白中核酸的去除。


运输与保存方法

≤0°C 运输;-25~-15°C 保存,两年效期(避免冻融)。


单位定义

在 37°C,pH 8.0 条件下,在 30min 内使△A260 的吸收值变化 1.0(相当于完全消化37μg 剪切鲑鱼精 DNA 成为寡核苷酸)所用的酶量定义为一个活性单位(U)。质量控制

• 蛋白酶残留:250KU/mL 的全能核酸酶与底物反应 60min,未检测到活力。

• 细菌内毒素(Endotoxin):LAL-Test,中国药典 2020 版第四部凝胶限度试验法 通(1143)。

• 微生物负载:中国药典 2020 版第四部无菌检查法 通则(1101),中华人民共和国国家标准,GB 4789.2-2016。


使用条件

• SDS 浓度超过 0.1%,EDTA 浓度超过 1mM时均会明显抑制核酸酶活力。

• 表活Triton X-100,Tween 20和Tween 80浓度不超过 1.5%对核酸酶性质无影响。

Q:共转录加帽T7体外转录试剂 (N1-Me-pUTP,CAP GAG )

产品概述


共转录加帽 T7 体外转录试剂,经过转录反应体系的优化,使用 T7 RNA 聚合酶(T7 RNA Polymerase)进行体外转录,以含有 T7 启动子序列的线性双链 DNA 为模板、NTPs 为底 物对启动子下游 DNA 序列进行转录,加帽试剂 CAP GAG(3'OMe)以共转录方式被掺入 mRNA 的 5'端,使客户能够简单快速地获得大量带有 Cap1 的 RNA 产物。Cap1 的添加 可以保护 mRNA 免于降解,从而确保 mRNA的翻译效率。本试剂盒内含常用的修饰核苷酸N1-Me-pUTP 供转录需求选择使用。修饰核苷酸可以有效降低 mRNA 的免疫原性,抑制先天免疫激活,使 mRNA 可能成为再生医学、疾病治疗和细胞重编程的有力工具。


本试剂盒一个反应能够转录获得 150~200 μg的 RNA 产物,并可放大生产毫克级别的 RNA。转录合成的 RNA 可用于 RNA 结构和功能研究、RNase 保护、探针杂交、anti-sense RNA和 RNAi 等应用。

运输与保存方法

≤0℃运输;-25℃~-15℃保存。

Q:高产T7体外转录试剂 (低dsRNA)

产品概述


T7 体外转录试剂盒(低dsRNA)经过T7 RNA聚合酶(T7 RNA Polymerase)突变体的筛选与转录反应体系的优化,以含有T7启动子序列的线性双链DNA为模板、NTPs为底物对启动子下游DNA序列进行转录,使客户能够简单快速地获得大量RNA产物,同时产物中的dsRNA较低。本试剂盒也能以修饰核苷为底物获得生物素、染料或放射性标记的RNA,以帽子结构或帽子类似结构为底物获得加帽的RNA。本试剂盒内含常用的修饰核苷N1-Me-pUTP供转录需求选择使用。


本试剂盒一个反应能够转录获得150~200 μg 的 RNA产物,并可放大生产毫克级别的RNA。转录合成的RNA可用于RNA结构和功能研究、RNase保护、探针杂交、anti-sense RNA和RNAi等应用,也可通过牛痘病毒加帽系统(HBP000606)和2’-O-甲基转移酶(HBP000701)加帽,Poly(A) Polymerase(HBP000801)加尾产生mRNA,用于体外翻译、转染等下游应用。


运输与保存方法

≤0℃运输;-25℃~-15℃保存。

Q:蛋白酶 K 溶液

产品概述

蛋白酶 K 是一种丝氨酸蛋白酶,具有高效的酶活性和广泛的底物特异性,能优先分解与疏水性氨基酸、含硫氨基酸、芳香族氨基酸 C末端邻接的酯键和肽键,常被用于降解蛋白生产短肽。它具有丝氨酸蛋白酶类所特有的典型催化三联体Asp 39-His 69-Ser 224特征并且活性中心周围有两个 Ca 2+结合位点增加其稳定性,使其在更广泛的条件下保持较高的酶活力。

产品信息:

产品名称 货号 规格
蛋白酶 K 溶液 HBP800001 1mL
HBP800002 10mL

用途

1. 基因诊断试剂盒;

2.RNA 和 DNA 提取试剂盒;

3.提取组织中非蛋白成份,降解蛋白质类杂质,譬如 DNA 疫苗和肝素的制备;

4.制备脉冲电泳的染色体 DNA;

5.蛋白质印迹;

6.用于体外诊断领域酶法糖化白蛋白试剂的研发和大量生产。

注意事项

使用时戴好防护手套和护目镜,使用后保存良好通风。该产品可能造成皮肤过敏反应。

活性测定方法

酶活定义

单位酶活定义为在规定条件下,每分钟水解酪蛋白生成 1 μmol L-酪氨酸所需的酶量。

试剂准备

试剂 I:底物:1%牛奶乳酪蛋白溶液:1 g 牛奶乳酪蛋白溶于 50 ml 0.1 M 磷酸钠盐溶液,pH 8.0,65-70 ℃水浴孵育 15 min 搅拌溶解,自来水冷却,氢氧化钠调节 pH 8.0,定容 100 ml。试剂 II:TCA 溶液: 0.1 M 三氯乙酸,0.2 M乙酸钠,0.3 M 乙酸(依次称取或量取 1.64g三氯乙酸+1.64g 乙酸钠+1.724ml 乙酸,加入 50ml 纯水中,HCl 调节 pH 4.03,定容100ml)。

试剂 III:0.4 M 碳酸钠溶液(称取 4.24g 无水碳酸钠溶解于 100ml 水中)。

试剂 IV:福林酚试剂:用纯水 5 倍稀释。

试剂 V:酶稀释液:0.1 M 磷酸钠盐溶液,pH 8.0。

试剂 VI:L-酪氨酸标准溶液:0、0.005、0.025、0.05、0.075、0.1、0.25 umol/ml 的 L-酪氨酸标准溶液,用 0.2 M HCl 溶解。

操作步骤

a 紫外可见分光光度计开机,选择光度测量。

b 参数设置波长为 660nm。

c 打开水浴锅,设置温度为 37℃,用温度计检测温度达到 37℃并维持 3-5min 不变。

d 将 2ml 离心管放置于离心管架上,做好标记,再向离心管中加入 0.5ml 底物,放入 37℃水浴锅预热 10min。

e 吸取 0.5ml 稀释好的酶液加入在水浴锅中预热的离心管中,计时反应 10min。空白组用酶稀释液替代酶液,其它步骤相同。

f 反应时间到,立即加入 1.0 mL TCA 试剂终止反应,加 TCA 的顺序与加酶液顺序相同,间隔时间也一致。拿出离心板架上下颠倒混匀后,放入水浴锅中继续孵育 30min,孵育结束后离心反应液。

g 从离心机中取出反应液,将离心管按离心前的顺序摆放好。在 5ml 离心管架上放上新的离心管,在管盖上做好标记。

h 在新的 5 mL 离心管中按顺序加入如下试剂:

i 将新的加入试剂的离心管颠倒混匀后,放置于 37℃水浴锅中孵育 30min。

j 分光光度计检测样品前用纯水在 660nm 处校零,样品孵育结束后,用紫外分光光度计在660 nm 检测样品吸光度 OD1,调节酶液稀释比例使吸光值保持在 0.13-0.25 的范围内。空白组用酶稀释液替代酶液,其它步骤相同,测定 OD2,则样品实际读数△OD=OD1-OD2。

k L-酪氨酸标准曲线:分别取 0.5 ml 不同浓度的 L-酪氨酸(0、0.005、0.025、0.05、0.075、0.1、0.25umol/ml)溶液,2.5ml 0.4M 碳酸钠,0.5 ml 福林酚试剂,加入 5mL 离心管中,混匀后 37℃孵育 30 min,测定不同 L-酪氨度为 0uM 的作为空白对照);根据酪氨酸浓度(Y)和对应的 OD660(X)值绘制 L-酪氨酸对 OD660 的标准曲线 Y=kX+b。

Q:RNase R

产品信息

产品名称 货号 规格
RNasee R (20U/μL) HBP004600-1 25μL
RNasee R (20U/μL) HBP004600-2 250μL

产品概述

RNase R(Ribonuclease R)是一种来源于大肠杆菌 RNR 超家族的 3’-5’核糖核酸外切酶,可从 3’-5’方向将 RNA 逐步切割成二核苷酸和三核苷酸。RNase R 可消化几乎所有的线性 RNA 分子,但不易消化环形 RNA、套索结构或 3’突出末端少于 7 个核苷酸的双链 RNA 分子。RNase R 常用于基因表达和可变剪切研究,可消化线性 RNA以使环形 RNA(circRNAs)或套索结构 RNA(lariat RNA)得到富集。RNase R 酶切线性RNA 以富集环状 RNA,用于从 total RNA 中构建内含子 cDNA 文库。

产品组分

HBP004600-1 组分 浓度 体积
RNase R(20 U/μL) 20U/ μL 25 μL
10×Reaction Buffer \ 1 mL
HBP004600-2 组分 浓度 体积
RNase R(20 U/μL) 20U/ μL 250 μL
10×Reaction Buffer \ 10 mL

运输与保存方法

≤0℃运输;-25~-18℃保存。

产品信息

产品名称 RNase R
产品性状 澄清透明液体
活性单位定义 在标准反应体系下,37 ℃ 10 分钟内将 1 μg poly-r(A) 转化成酸溶性的核苷酸所需要的酶量定义为一个活性单位 (U)
反应最适温度 37 ℃
储存缓冲液 50 mM Tris-HCl (pH 7.5 @ 25°C),100 mM NaCl,1mM DTT, 0.1 mM EDTA,50%Glycerol,0.1% Triton® X-100
10×Reaction buffer 200 mM Tris-HCl (pH8.20 @25℃),1 mM MgCl2,1 M KCl
储存条件 -25 ~ -18℃,避免反复冻融

质量控制

  • 纯度(SDS-PAGE):≥95%.
  • E. coli 残留 DNA: RT-qPCR 检测 10 μ L RNase R 的 16S rDNA 基因的 Ct 值≥35。
  • 核酸内切酶的活性:在含有至少 10 U RNase R 的 20 μL 反应中,与 1 μg dsRNA 在 37℃下孵育 4 小时,没有检测到降解。
  • Dnase 的活性:在含有至少 10 U RNase R 的 10 μL 反应中,与 1 μg pUC19 DNA 在 37℃下孵育 4 小时,没有检测到降解。
  • 功能分析:RNase R 在含有 10 U RNase R和 3 μg 293T 细胞的总 RNA 混合物的反应中进行功能测试。RT-qPCR 检测 RNA 丰度。经 RNase R 酶切和不酶切计算,线性 RNA 的 ΔCt 值≥4.5,环形 RNA 的 ΔCt 值≤1。

反应体系和条件

组分 体积(20μL) 体积(50μL)
无核酸酶水或 DEPC 处理水(20U/μL) Up to 20 μL Up to 50 μL
10×Reaction Buffer 2 μL 5 μL
RNA <5 μg >5 μg
RNase R (20 U/μL) 1-3 U/μg RNA 1-3 U/μg RNA

按以上顺序添加反应组分

*RNase R 需要低(0.1-1.0 mM)镁浓度才能发挥活性。底物RNA 溶液中 EDTA 浓度低会对 RNase R 活性产生负面影响。MgCl2 高达 1mm 的终浓度可用于补偿底物中的 EDTA。37℃时活性最佳。

反应时间:37℃孵育 15 min。

反应终止:70°C 加热 10 min。

纯化回收 消化后的 RNA 可使用苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1, V:V)溶液(或 Trizol Reagent)抽提,再使用乙 醇沉淀回收;或者使用 RNA纯化柱或磁珠进行纯化回收。

常见问题

  1. 消化时间的选择

一般 10-30 min 即可消化掉大部分线性RNA,RT-qPCR 检测线性 RNA 丰度有几百倍的降低,也可按需求适当延长消化时间,但不推荐 1h 以上的消化,因为时间过长可能导致少数耐受力弱的环状 RNA 被消化。

  1. 内参的选择与定量计算

情况 1:RNase R 消化后“直接”进行RT-qPCR 检测对消化组(RNase R+)与对照组(RNase R-)的 circRNA 的进行定量计算时,应统一以对照组(RNaseR-)的β-actin 或 GAPDH 为内参。

情况 2:RNase R 消化后“纯化回收”再进行 RT-qPCR 检测在纯化前加入少量其他物种的 RNA 作为外参,统一以外参标准化样品后再进行计算。

3 . 实验结果一致性(重复性)差

① RNase R 消化/逆转录/PCR 过程中加样不准确;

② RNase R 的用量有偏差;

③ 其他 RNase 污染。

4 . 线性 RNA 未消化

① 反应 体系 中的 NaCl 浓度 过高 抑制 了RNase R 的活性,或存在 RNase R 的失活剂EDTA;

② 某些没有 3’突出末端的结构化线性RNA 或含有 G-四联体的线性 RNA 可能耐受RNase R 消化。

5 . 环状 RNA 也被消化

①外源 RNase 污染,使用 RNase-Free 耗材,反应体系可适当加入 RNase 抑制剂;

②少数环状 RNA 耐受 RNase R 消化力弱的,可尝试减少 RNase R 用量或缩短消化时间。

Q:E.coli 细胞残留 DNA 检测试剂盒

规格

货号 规格
HBP003503 100 reactions

预期用途

本试剂盒利用 TaqMan 荧光探针的 qPCR 检测原理对重组蛋白、抗体、疫苗等生物制品中 E.coli 细胞残留 DNA 进行定量测定,检测快 速,专一性强。仅供研究使用,不可用于临床。本检测方法可溯源至中国药典方法,通则<3407>。

试剂盒组成

名称 规格 支数 储存条件
E.coli DNA Positive Control 30ng/μL 50μL/μL 1 -25℃~-15℃
Compound of primers and probes 0.5mL 1 -25℃~-15℃,避光
qPCR Master Mix 1.5mL 1 -25℃~-15℃,避光
DNA Dilution Buffer 1.5mL 1 -25℃~-15℃

储存条件及有效期

  1. 有效期:规定储存条件下 24 个月。
  2. 运 输 和 储 存 : 长 时 间 储 存 请 放 置 在 -25~-15℃ ,运输过程中请放置在干冰或冰 袋中。

E.coli DNA 阳性对照标准曲线样品的 制备

E.coli DNA 阳性对照品浓度标注于管壁标签上,确认实际浓度后再进行稀释。用试剂盒中提供的DNA稀释液将CHO DNA阳性对照品进行梯度稀释,稀释浓度依次为3000pg/μL、300pg/μL、30pg/μL、3pg/μL、0.3pg/μL、0.03pg/μL、0.003pg/μL。

具体操作如下:

  1. 将试剂盒中的 E.coli DNA 阳性对照品和DNA 稀释液从-20℃取出后置于冰上融化,待完全融化后,轻微振荡混匀,快速离心 2~5秒。
  1. 取 7 支低吸附离心管,分别标记为 ST0、ST1、ST2、ST3、ST4、ST5 和 ST6。按下表准备 E.coli DNA标准样品,每步稀释后各管均用旋涡混合器混匀,快速离心 2~5 秒,再进行下一个梯度稀释,标准样品稀释完后2~8℃保存,现配现用。

E.coli DNA 阳性对照品的稀释

稀释管 稀释步骤 浓度(pg/μL
ST0 10μL DNA 阳性对照品 + 90μL DNA 稀释液 3000
ST1 10μL ST0 + 90μL DNA 稀释液 300
ST2 10μL ST1 + 90μL DNA 稀释液 30
ST3 10μL ST2 + 90μL DNA 稀释液 3
ST4 0μL ST3 + 90μL DNA 稀释液 0.3
ST5 10μL ST4 + 90μL DNA 稀释液 0.03
ST6 10μL ST5 + 90μL DNA 稀释液 0.003

已融化未使用的 DNA 稀释液可暂存于 2-8℃

加样回收质控 ERC 的制备

根据需要设置 ERC 中的 E.coli DNA加标量 (建议加标量设定为其样品历史无加标测试值的 2~30 倍),以制备加 30pg CHO DNA量的供试品 ERC 为例,

具体操作如下:

  1. 取100μL供试品加入1.5mL低吸附离心管中。
  1. 加入 10μL ST3,混匀,标记为供试品 ERC。
  2. 样本 ERC 与同批供试品一起进行前处理,制备成供试品 ERC 纯化液。

阴性质控 NCS 的制备

根据实验设置阴性质控,

具体操作如下

  1. 取 100μL 供试品基质溶液(或 DNA 稀释液)加入 1.5mL 低吸附离心管中标记为阴性质控 NCS。阴性质控 NCS 和同批供试品一起进行前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。

qPCR 反应体系

1.根据所要检测的标准曲线及待测样本数量,计算所需反应孔数。反应孔数=(6 个浓度梯度的标准曲线样品

+1 个空白对照 BLK+1 个阴性质控 NCS+供试品+供试品 ERC)×3;

2.根据反应孔数计算本次所需的反应混合液的总量:反应混合液总量=(反应孔数+2)×(15μL qPCR Master Mix + 5μL Compound of primers and probes)(含有 2 孔的加样误

差损失量)

3.各试剂置于室温融化后,根据上一步所计算的引物与 Mix 的量配置所需要的反应混合液,轻微振荡混匀,然后按下表所示加样

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